Naast microscopen en petrischaaltjes , computers zijn een belangrijk instrument voor microbiologen . Software voor microbiologie onderzoek omvat instrumenten die worden gebruikt door andere wetenschappelijke en technische disciplines , alsook gespecialiseerde toepassingen voor de studie van bacteriën en andere micro - organismen . Veel toepassingen ontwikkeld door overheidsinstellingen , non - profit stichtingen of academische onderzoekers zijn verkrijgbaar als gratis software te downloaden en te gebruiken als uw experiment of lab vereist . Gereedschap visualisatie
Een fysieke of mentale beeld van de ruwe gegevens die je verzamelt kan je helpen beter te begrijpen zijn kwaliteit , betekenis en implicaties . Open source en commerciële data visualisatie software is op grote schaal beschikbaar voor microbiologie onderzoek . Maak diagrammen en grafieken van uw gegevens met behulp van LibreOffice Calc , Microsoft Excel of de Mondriaan data - visualisatie systeem . Cell - O en RasMol toepassingen helpen u 2D-en 3D - geanimeerde modellen van biologisch belangrijke moleculen zoals eiwitten en aminozuren te creëren .
Mathematical Modeling
Grote collecties van de microbiologie gegevens vaak opbrengst meer zinvolle informatie zodra ze zijn numeriek geanalyseerd . MATLAB , Octave en SciPy softwarepakketten die wiskundige verfijning , analyse en modellering van gegevens wetenschappers ' te voeren . Gebruik deze pakketten om parameters schatten door curve fitting , epidemiologische voorspellingen , bacteriegroei simulaties en data ruis of stochastisch effect eliminatie doen . Deze applicatie ook statistische berekeningen uitvoeren , zoals variantie-analyse of Chi - kwadraat toetsen .
Genome Bioinformatica
Microbiologie softwaretoepassingen
ook helpen informatie te visualiseren en de mijne van de sequentie van nucleïnezuren die deel uitmaken van het DNA van een micro - organisme . De Open Bioinformatics Foundation biedt gratis, open - source DNA- sequencing en analyse toepassingen zoals BioJava en biopython dat uittreksel gegevens van genoominformatie banken , ontleden DNA code van een organisme en vergelijk het met andere DNA-monsters . Extra genoomanalyse pakketten bevatten Reliëf , HMMER , Clustal Omega , Phylogeny Inference Package , of PHYLIP , en de Sequence Manipulatie Suite of SMS .
Reference Software
De snelle tempo van de wetenschappelijke ontdekking in de microbiologie en veranderende regelgeving van de overheid maakt het noodzakelijk dat microbiologen gemakkelijk toegang hebben tot de informatie die hun werk beïnvloedt . HUGO is een commercieel softwarepakket dat microbiologen voorziet van actuele informatie over instrumenten , chemicaliën , apparatuur , cultuur media , veiligheidseisen , nieuwe organismen , taxonomische veranderingen en antibiotica . Daarnaast kunnen microbiologen die werkzaam zijn in food science het ComBase Browser webapplicatie gebruiken om toegang te krijgen tot de voedsel-gerelateerde microbiologische gegevens van overheidsinstanties in het Verenigd Koninkrijk , Australië en de Verenigde Staten .
|
