* Verhoogde complexiteit: Coderen en decoderen voegt lagen van complexiteit toe aan het softwareontwikkelingsproces. Foutopsporing wordt moeilijker en het begrijpen van de gecodeerde gegevens vereist gespecialiseerde kennis. Dit kan de ontwikkeltijd en -kosten verhogen.

* Prestatieoverhead: Coderings- en decoderingsprocessen verbruiken verwerkingskracht en geheugen. Dit kan leiden tot lagere uitvoeringssnelheden, vooral op apparaten met beperkte middelen. De overhead kan aanzienlijk zijn, vooral bij complexe coderingsalgoritmen.

* Compatibiliteitsproblemen: Verschillende coderingsschema's zijn mogelijk niet compatibel met elkaar. Dit kan problemen veroorzaken bij het delen van gecodeerde gegevens tussen verschillende systemen of applicaties. Mogelijk hebt u specifieke decoders of bibliotheken nodig die mogelijk niet altijd beschikbaar zijn.

* Beveiligingsproblemen: Hoewel codering de veiligheid kan verbeteren, kunnen slecht geïmplementeerde coderingsschema's kwetsbaarheden introduceren. Zwakke versleutelingsalgoritmen of onjuist sleutelbeheer kunnen de gegevens gevoeliger maken voor aanvallen in plaats van ze te beschermen.

* Verhoogde opslagvereisten (in sommige gevallen): Terwijl sommige coderingsschema's gegevens comprimeren, kunnen andere de bestandsgrootte *vergroten*, waardoor de voordelen van codering teniet worden gedaan en opslagruimte wordt verspild.

* Gegevensverlies (bij compressie met verlies): Compressieschema's met verlies (zoals sommige audio- of beeldcodecs) verwijderen permanent bepaalde gegevens om hogere compressieverhoudingen te bereiken. Dit is acceptabel voor sommige toepassingen (bijvoorbeeld het streamen van audio/video waarbij een klein kwaliteitsverlies niet waarneembaar is), maar onaanvaardbaar voor andere (bijvoorbeeld medische beeldvorming).

* Licenties en kosten: Sommige coderingsschema's en gerelateerde bibliotheken kunnen bedrijfseigen zijn en licenties vereisen, wat de financiële lasten voor het project vergroot.

* Reverse-engineering: Hoewel het doel is gegevens te beschermen, kan geavanceerde codering worden reverse-engineered, vooral als het algoritme zwak is of de implementatie gebrekkig is. Dit ondermijnt de beoogde veiligheidsvoordelen.

* Moeilijkheden bij het opsporen van fouten en onderhoud: Gecodeerde gegevens zijn moeilijker te inspecteren en te debuggen dan gewone tekst of binaire gegevens, waardoor onderhoud en probleemoplossing moeilijker worden. Het opsporen van fouten in gecodeerde datastromen vereist gespecialiseerde tools en expertise.

De keuze om wel of niet coderingssoftware te gebruiken hangt af van een zorgvuldige afweging van deze nadelen tegen de potentiële voordelen in specifieke situaties. De voordelen wegen vaak zwaarder dan de nadelen in gevallen waarin compressie, beveiliging of standaardisatie van gegevensformaten van cruciaal belang zijn. Om tot een passende oplossing te komen is echter een grondige evaluatie noodzakelijk.