Voordelen:

* Eenvoud: Seriële muizen waren relatief eenvoudige apparaten, zowel qua hardware als qua software die nodig was om ermee te communiceren. Dit betekende minder potentiële faalpunten en eenvoudiger ontwikkeling van stuurprogramma's.

* Compatibiliteit (in zijn tijd): In het tijdperk van hun dominantie waren seriële poorten standaard op vrijwel alle computers. Dit zorgde voor een brede compatibiliteit tussen verschillende systemen.

* Lagere kosten (aanvankelijk): Vroege seriële muizen waren over het algemeen goedkoper dan de oorspronkelijke PS/2 of andere vroege muistechnologieën.

Nadelen:

* Beperking van één poort: Het grootste nadeel was het gebruik van een seriële poort. Computers hadden slechts een beperkt aantal van deze poorten (meestal slechts één of twee), waardoor het aantal randapparatuur dat tegelijkertijd kon worden aangesloten beperkt was. Dit was een grote beperking vergeleken met het vermogen van USB om veel apparaten op één bus te verwerken.

* Langzamere gegevensoverdrachtsnelheden: Seriële communicatie is inherent langzamer dan PS/2 of USB, wat resulteert in een lagere responsiviteit en mogelijk merkbare vertraging, vooral bij muizen met een hogere DPI.

* Hardwareconflicten: Meerdere seriële apparaten kunnen met elkaar in conflict komen, waardoor een zorgvuldige configuratie en mogelijk handmatige tussenkomst nodig is (bijvoorbeeld het toewijzen van COM-poortnummers).

* Kwetsbare connectoren: De DB-9 seriële connectoren waren enigszins gevoelig voor beschadiging, vooral vergeleken met de robuustere PS/2- of USB-connectoren. Dit was een zorg voor fysieke duurzaamheid en betrouwbaarheid.

* Beperkte functionaliteit: Seriële muizen misten meestal geavanceerde functies zoals extra knoppen of programmeerbare DPI-instellingen, die latere muizen wel kregen.

* Veroudering: De vrijwel universele adoptie van PS/2 en vervolgens USB maakte seriële muizen overbodig. Het vinden van nieuwe of vervangende onderdelen is nu uiterst moeilijk.

Kortom, hoewel seriële muizen in hun tijd eenvoud en compatibiliteit boden, leidden hun beperkingen in snelheid, poortbeschikbaarheid en algehele functionaliteit ertoe dat ze volledig werden vervangen door nieuwere technologieën.