Knoppix
, net als zijn neven Linux , heeft een ingebouwde , robuuste beveiliging recht uit de doos . Programma's zijn niet uitvoerbaar standaard in Linux . Een gebruiker met de juiste machtigingen instellen , moet expliciet maken elk binair bestand executable.The meerderheid van de software voor Linux is open source , wordt geïnstalleerd via de officiële kanalen en ondergaat strenge peer review alvorens te worden vrijgelaten . Virussen zijn geschreven voor het besturingssysteem , maar zijn er maar weinig tussen en heb nog nooit wijdverspreid geweest .
Live CD

Knoppix
is uniek onder de Linux- distributies in dat het is ontworpen om te worden opgestart en uitgevoerd vanaf een Live

cd of dvd
. De optische media waaruit Knoppix wordt gerund kan niet om door virussen en andere malware worden geschreven . Zelfs als malware zijn weg gevonden in het RAM , het zou worden gedoofd wanneer Knoppix werd stilgelegd .
Scanning Andere Besturingssystemen

Knoppix
, met een antivirusprogramma geïnstalleerd is van onschatbare waarde voor het scannen van andere besturingssystemen voor virussen . Hoewel zijn native media niet kan worden geschreven naar , kan Knoppix programma's installeren of upgraden componenten in RAM of in een kleine map op uw harde schijf . Met een antivirusprogramma in Knoppix geïnstalleerd, kunt u scannen en reinigen van uw Windows-systeem zonder angst dat er malware is verstopt in Windows geheugen of met behulp van andere trucs te verbergen van je basis Windows-installatie of op de harde schijf .