1. Ergonomische problemen: Langdurig gebruik van een muis kan leiden tot repetitieve rekletsels (RSI's) zoals carpaal tunnelsyndroom, peesonitis en andere musculoskeletale problemen. Dit komt omdat de repetitieve bewegingen van de hand en pols spieren, pezen en zenuwen kunnen spannen.

2. Beperkte precisie: Hoewel muizen goed zijn voor algemene navigatie en selectie, kunnen ze minder nauwkeurig zijn dan andere invoermethoden, vooral voor taken die fijne controle vereisen. Het tekenen of bewerken van afbeeldingen kan bijvoorbeeld eenvoudiger en nauwkeuriger zijn met behulp van een stylus of tablet.