Hoewel beide informatie over partities (logische schijfeenheden) bevatten, verschilt de manier waarop ze dit doen aanzienlijk. De MBR is een oudere standaard, beperkt in het aantal en de grootte van de partities die hij kan beheren. GPT is de nieuwere en meest voorkomende standaard en biedt meer flexibiliteit. Beide fungeren in wezen als een map naar de startlocatie van elke logische schijfeenheid op de fysieke schijf.