- Bestandsrechten :NTFS ondersteunt bestandsmachtigingen, waarmee u kunt bepalen wie toegang heeft tot bepaalde bestanden en mappen. FAT32 beschikt niet over deze functie, dus elke gebruiker met toegang tot de partitie heeft toegang tot elk bestand erop.

- Codering :NTFS ondersteunt codering, waarmee u de inhoud van uw partitie kunt coderen, zodat ongeautoriseerde gebruikers er geen toegang toe hebben. FAT32 beschikt niet over deze functie, dus alle gegevens op de partitie zijn kwetsbaar voor diefstal als de partitie wordt gestolen of gecompromitteerd.

- Schijfquota :NTFS ondersteunt schijfquota, waarmee u de hoeveelheid ruimte kunt beperken die elke gebruiker op de partitie kan gebruiken. FAT32 beschikt niet over deze functie, zodat gebruikers mogelijk de hele partitie kunnen vullen met hun gegevens, waardoor andere gebruikers deze niet kunnen gebruiken.

- Journaliseren :NTFS gebruikt een journaalsysteem om wijzigingen in de partitie bij te houden. Hierdoor kan de partitie gemakkelijker worden hersteld in het geval van een systeemfout. FAT32 beschikt niet over deze functie, dus als het systeem uitvalt, kunnen gegevens verloren gaan of beschadigd raken.

Over het algemeen is NTFS een veiliger bestandssysteem dan FAT32. Als u zich zorgen maakt over de veiligheid van uw gegevens, moet u NTFS gebruiken.