1. IO.SYS :regelt de basisinvoer-/uitvoerfuncties van het systeem, inclusief het afhandelen van interrupts, het beheren van het toetsenbord en het communiceren met hardwareapparaten.

2. MSDOSSYS.SYS :Bevat de kerncode van het besturingssysteem en is verantwoordelijk voor het laden en uitvoeren van andere systeembestanden, waaronder CONFIG.SYS en AUTOEXEC.BAT.

3. COMMAND.COM :de opdrachtinterpreter waarmee gebruikers opdrachten kunnen uitvoeren door deze bij de opdrachtprompt te typen.

4. CONFIG.SYS :een tekstbestand met instructies voor het configureren van hardwareapparaten en het laden van apparaatstuurprogramma's.

5. AUTOEXEC.BAT :een batchbestand dat automatisch wordt uitgevoerd tijdens het opstartproces en opdrachten bevat voor het instellen van de systeemomgeving.

6. WIN.COM :De Windows 98-kernel die de grafische gebruikersinterface (GUI) laadt en systeemprocessen en geheugen beheert.

7. SYSTEEM.INI :een bestand waarin systeembrede configuratie-informatie wordt opgeslagen, zoals weergave-instellingen, netwerkconfiguraties en systeemlettertypen.

8. WININIT.INI :een bestand waarin gebruikersspecifieke configuratie-instellingen worden opgeslagen, zoals bureaubladpictogrammen, mapopties en taakbalkinstellingen.

9. GEBRUIKER.DAT :een bestand dat gebruikersprofielgegevens bevat, inclusief persoonlijke instellingen, voorkeuren en bureaubladaanpassingen.

10. GDI.EXE :De grafische apparaatinterface (GDI) verwerkt grafische functies, waaronder het tekenen van lijnen, vormen en tekst op het scherm.

11. USER32.DLL :de kernbibliotheek van de gebruikersinterface die interacties met vensters, menu's, knoppen en andere grafische elementen afhandelt.

12. KERNEL32.DLL :de kernsysteembibliotheek die basisservices van het besturingssysteem biedt, zoals geheugenbeheer, het maken van processen en bestandsbewerkingen.

13. KRNL286.EXE :een beschermde modusuitbreiding van de kernel die toegang geeft tot uitgebreid geheugen en verbeterde processorfuncties.

14. VMM32.VXD :De virtuele machinebeheerder die het virtuele geheugen beheert, waardoor programma's tegelijkertijd in hun eigen geïsoleerde geheugenruimtes kunnen worden uitgevoerd.

15. CONFIG.NT :een bestand dat netwerkconfiguratie-informatie bevat, zoals netwerkprotocollen en IP-adressen.

Deze bestanden zijn essentieel voor het succesvol opstarten en functioneren van Windows 98. Als een van deze bestanden ontbreekt, beschadigd is of onjuist is gewijzigd, kan dit leiden tot een opstartfout of andere systeemstoringen.